此时的万历已不复之前的颓势，既然决定根除后金，那自然是要一棒子打死，免得再祸害后世子孙。
他翻阅手机中的《明史》，此时后金不过部落联合，内部不稳，万历灵光一闪，暗道：“姜先生之策，恩威并施，方是正道！朕要命熊廷弼招抚降部，瓦解后金，擒贼首努尔哈赤，以绝后患！”
他亲笔御批，赐熊廷弼金牌令箭，命其继续进兵，收复铁岭，修筑防线，屯兵驻守。
万历又拨银百万两，命工部侍郎徐光启加速火器研发，在辽东设厂，源源不断供应前线，确保大军无后顾之忧。
他叮嘱熊廷弼：“女真部落，利害不一，努尔哈赤虽强，然众叛亲离之势已成。
卿当以火器震慑，以恩德招抚，务使辽东永固！”
熊廷弼叩首领命，誓道：“臣定不负陛下所托，擒努尔哈赤，献于京师！”恩威并施，招抚女真万历四十五年十月，熊廷弼率大军驻扎抚顺，修筑堡垒，囤积粮草，稳固防线。
他深谙《诸天治国简录》中“恩威并施”之策，知晓后金虽建国，然不过女真部落松散联合，努尔哈赤以武力压服各部，内部矛盾重重。
熊廷弼召集幕僚，商议招抚之策，言道：“女真各部，多为生计所迫，随努尔哈赤叛乱。
若以恩德招安，许以田地、官爵，定能分化其势！”他命锦衣卫密探潜入女真腹地，散布大明军威，宣扬朝廷恩德，许诺降部免罪，赐田赏银，封官赐爵。
手机中下载的《明史》记载，女真部落多有怨言，努尔哈赤赋税苛重，征战不休，部众苦不堪言。
熊廷弼抓住时机，亲笔书信，遣使送往海西女真、野人女真等部，言明大明愿以仁德待之，凡降者，不仅免罪，还可保留部族自治，赐予耕牛、种子，助其安居乐业。
海西女真首领叶赫部贝勒布扬古首当其冲，率先归降。
叶赫部与努尔哈赤素有宿怨，闻大明火器犀利，抚顺一战大败后金，布扬古心动不已，率部众三千归顺，献上努尔哈赤的布防图。
熊廷弼大喜，封布扬古为辽东副总兵，赐银万两，田千顷，命其率部协助大明军作战。
叶赫部的归降，如雪球滚下，引发连锁效应。
辉发部、乌拉部等中小部落，见大明军势如虹，努尔哈赤连战连败，纷纷倒戈，遣使向熊廷弼投诚。
瓦解后金联盟后金内部，努尔哈赤闻诸部叛离，怒不可遏，召集诸贝勒商议。
皇太极皱眉：“父汗，大明火器犀利，又以恩德招抚，诸部离心，我军处境堪忧！”
代善附和：“叶赫部叛变，献我布防图，大明军已知我虚实，宜暂避锋芒！”
努尔哈赤怒道：“避？本汗宁死不退！”
然部下士气低落，诸贝勒各怀异志，联盟摇摇欲坠。
熊廷弼趁势而为，依《诸天治国简录》中“攻心为上”之策，命降部首领游说其他部落，散布努尔哈赤残暴无道、赋税苛重之言，动摇其军心。
他又命锦衣卫散布谣言，称努尔哈赤欲将诸贝勒之权收归己有，挑拨其内部矛盾。
皇太极、代善等贝勒闻讯，暗生戒心，努尔哈赤的权威进一步削弱。
与此同时，熊廷弼挥师进逼铁岭，后金守军早已人心惶惶。
徐光启督造的新式火炮运抵前线，威力惊人，一炮轰塌铁岭城墙，守军未战先溃。
熊廷弼命火器营齐射，铅弹如雨，女真骑兵死伤惨重，铁岭一战，后金再败。
努尔哈赤率残部退守赫图阿拉，内部离心之势愈发明显。
阿敏、莽古尔泰等贝勒私下密议，欲与大明议和，以保家族权势。
万历四十六年三月，熊廷弼集结十二万大军，携火器营，直逼后金老巢赫图阿拉。
努尔哈赤困守孤城，兵力不过两万，粮草匮乏，部下离心。
他召集诸子与贝勒，怒道：“大明欺人太甚，本汗誓死一战！”
皇太极却低声道：“父汗，我军连战连败，火器不及大明，诸部叛离，不如议和，保全实力！”
努尔哈赤怒斥：“议和？宁死不降！”
可惜此时军心已散，诸贝勒不再唯命是从。
熊廷弼布下天罗地网，火器营封锁赫图阿拉外围，步兵掘壕围城，骑兵断其粮道。
他命降部首领布扬古喊话，许诺凡擒努尔哈赤者，封侯赐金。
阿敏见大势已去，暗中与熊廷弼联络，愿献城投降，交出努尔哈赤以换取活命。
熊廷弼允其请，命锦衣卫潜入城内，协助阿敏行动。
五月，赫图阿拉城内大乱，阿敏率部倒戈，打开城门，大明军长驱直入。
火器营火炮齐鸣，城墙崩塌，步兵蜂拥而入，努尔哈赤与皇太极、代善等子侄被困汗宫，负隅顽抗。
熊廷弼亲率精锐，火铳齐射，汗宫守军死伤殆尽。
努尔哈赤持刀力战，终因寡不敌众，被锦衣卫生擒，皇太极、代善、莽古尔泰等一众子侄亦被缚。
后金都城陷落，联盟彻底瓦解，残部四散逃亡。
万历四十六年七月，熊廷弼押解努尔哈赤及其子侄皇太极、代善等，班师回京。
京师百姓闻讯，夹道欢迎，街头巷尾，锣鼓喧天。
万历亲临午门，检视俘虏，见努尔哈赤须发凌乱，昔日雄姿不再，怒道：“女真鞑子，敢犯我大明天威，今日何也？”
努尔哈赤咬牙不语，皇太极低头沉默。
万历冷哼：“押赴刑场，明正典刑，以儆效尤！”
努尔哈赤及其子侄于京师菜市口问斩，女真叛乱彻底平定。
万历下旨，赦免降部，赐田赏银，命其归顺大明，永镇辽东。
熊廷弼因功封侯，徐光启加太子太保，火器营立为常备军，驻守辽东。
京师茶肆酒楼间，百姓议论纷纷：“陛下圣明，灭女真，收辽东，大明中兴有望！”民心归附，国势如虹。