多尔济终于如愿以偿，朝廷明令废除了仓央嘉措的达赖喇嘛名号，赫寿并传皇帝口喻，让其寻找五世达赖转世真身。可没过多久，他就感到脚下的土地犹如翻滚的岩浆，人们用各种方法表达对仓央嘉措的怀念，洛桑写的情歌，在城镇、乡村和草原广泛传唱，他的遭遇也引发人们的同情，甚至关于他的结局也流传着多种版本。
多尔济需要尽快找到所谓真正的六世达赖。
旺秋离开后，药王庙住持从僧人中挑选了一名作江央的助手，他和江央是同学，叫曾巴，不但成绩优秀，性格也忠厚老实，大家都清楚江央的家世，关照她，曾巴也深表同情。交往中，江央发现曾巴对自己的家世极力回避，好像也从未回过家。
尼雅嫁给了西街一个商人，日子可算小康，时不时上山看望小姐。
有一天，江央得知，曾巴离开药王山了，为什么？往何处？没人知道。
五月初，大昭寺贴出通告，十五日煨桑节上，六世达赖喇嘛将出席法会并作开示。大家一开始都很惊讶，弄不清怎么回事，很快就传出消息，这位达赖是由拉昌汗刚找到，据说是个真的。江央有自己的想法，不过出于好奇，那天也去了。
新达赖是傍晚才出现的，加上满城烟雾，瞧不大清楚，人们使劲向前拥挤，心态和表情如同是在观看藏戏中一个演员。江央看着很眼熟，又见药王庙的僧人都在嘁嘁喳喳，再定睛细瞅，不觉一惊，那不是曾巴吗？他怎么……而且她能察觉出曾巴内心的忧伤与无奈。
拉萨人是机灵敏锐的，而且不爱保密，没多久，新达赖的背景和寻认过程就人尽皆知了。二十多年前，十王爷多尔济看上了府中年轻守寡的熬茶厨娘。有了他们的孩子后，取名曾巴，送给东街一对乞丐夫妇，并赠与银钱开了一家小店。厨娘每年都以姑姑名义探望儿子数次，孩子懂事后，渐渐觉得这位姑姑与自己关系不寻常，于是追问乞丐夫妇，看看瞒不住，只好告诉孩子，“姑姑”其实就是亲生母亲。
曾巴与厨娘相认后，自然要询问生父是谁，厨娘只好推脱，说待长大些再告之。就这样又过了三两年，曾巴已感到自己身世蹊跷，周围邻居的目光也变得复杂，十五岁那年，他决定出家，厨娘和养父母劝止不住，只好由他出家在不远处一座小庙。药王山医学班开办后，开始那些年只招收三大寺等大庙学员，不知通过什么关系，曾巴破例入学，毕业后留在寺内担任小执事。
多尔济重新寻找五世达赖转世灵童的过程非常简单：按五世圆寂的时间推算，六世达赖该是二十四五岁，多尔济列出了新达赖必须符合的若干条件，最后的结果是，只有他这个至今未见过面的儿子，是唯一全部达标的人选。
期间过程，外人不在跟前，无从知晓。可但凡歌舞民族都富于想象力，煨桑节后不出数日，吉朵即以说书的形式，演绎了这段秘史。共分四节：一、惊闻身世；二、父子相认；三、晴天霹雳；四、清冷坐床。头一节内容曲折引人入胜。第二节的场面据说也颇为动人。第三节使听众均对“父亲”面露不屑之色。第四节听毕，僧俗众生的态度明朗，也对这位无辜的年轻人明确表示同情。
这是一种特有的机智幽默，还未公开较量，已经先声夺人。
坐床法会只有宫中喇嘛参加，根柱起先对新主人抵触，当他后来探测到曾巴的内心深处时，也不禁投以同情。丹珠尔因根柱与洛桑的关系，派其做杂役，后来曾巴特意将其要到身边做随身侍从。
典礼后，多尔济安排丹珠尔陪同曾巴赴三大寺——只要三大寺肯接纳，新达赖的身份就名正言顺了。没想到，哲蚌寺和色拉寺闭门不纳，甘丹寺虽然勉强开了门，但对曾巴没有按历来的习惯称“佛爷”，只称“阁下”。
多尔济嗅到了浓重的危机意味儿，他清楚，如果新达赖得不到承认，自己将遭到蒙藏全体信众的反对，也会被朝廷抛弃。他果断采取了三项措施。
第二天，一支骑兵驰向敏珠林寺，宣读了汗王府和第巴府决定，削减大部僧人，将多数殿堂没收，移作他用，并任由骑兵在寺内纵马践踏。临走时，一个头目喝令把寺门上的木匾摘下，敏珠活佛上前一把抱住，说明此匾乃五世达赖亲书所赐，不可毁坏。头目张弓搭箭欲射，活佛转身紧抱不舍，一箭飞来，穿透后心，八十岁的老活佛护匾身亡。骑兵乃去。该匾后由寺僧藏于洞内，七世达赖时又取出挂上，原物至今存于敏珠林寺内。
多尔济通过打击宁玛，以示尊黄，其他红教寺庙，如多吉扎寺、香色寺等寺庙均受波及，就连南杰盘德林寺也为逃过池鱼之殃。
多尔济的第二项措施，翻动了五世达赖所立、桑结嘉措致力巩固的整个甘丹颇章政权的基石。大昭寺前张贴出两府布告，指斥桑结嘉措佞红削黄，决定将收归宫中所有、第巴府管理的三大寺属地、牧场一律退还，另外对三大寺和黄教其他主要寺庙，赏赐大量土地，并取消对新建寺庙和僧人定额的限制。这样的结果是，尔后三十年间，新增寺院一千七百座，总数达三千一百余座；新增僧人二十二万，总数近三十二万；属民由原来的极少量，增至六十四万多人。
此外，主要寺院还拥有对僧众和属民的司法权。
如此，仅数十年，原本戒律严明的黄教和甘丹颇章根基受到严重侵蚀，有的现象真可说触目惊心。乾隆年间，为克服藏中寺庙种种弊端，加强管理，出台了两部章程，在《钦定章程》（二十九条）之第十八条中，明确指出：“近查各大寺之活佛，拥有很多庄园，并因享有群众信仰，所献贡物者很多，再加经商谋利，贪财好货，甚不称职。”
物质财富的诱惑，政教合一的体制，使本来神圣的僧职、名号，变成逐利的手段，有的活佛及重要僧职，互为姻亲或同出一族，故在《钦定章程》第一条中又明示，“大皇帝为了黄教的兴隆，和不使护法弄假作弊”，“特赐一金瓶”，规定达赖、班禅、章嘉、哲布和雍和宫大喇嘛等黄教高层大活佛的灵童，必须经由金瓶掣签法来确认。对其他大活佛转世的确认也规定了严格办法。
但争夺没有停息，甚至以极端形式蔓延到布达拉宫。
九世达赖十一岁于宫中暴亡。
十世达赖二十二岁于宫中暴亡。
十一世达赖十八岁于宫中暴亡。
十二世达赖二十岁于宫中暴亡。
厚厚的宫墙，不知遮掩了多少内幕。随之而来的吏治腐败、法度松弛，加剧了社会的不公。
乾隆对藏事多有研究，在《酌定西藏善后章程》（十三条）中，道出问题根源：“查旧例，全藏人民均属达赖喇嘛所属，按地方之大小，人户之多寡，各有一定差徭，以供黄教佛事，并备众僧熬茶之用。”然近时以来，“旧例废驰”，“不但任意私为占有，又复施恩于私人，滥行赏赉者甚多。”尤其对乌拉差役，私出牌票，种种加派，“以致百姓差徭加倍，苦累不堪，因此而致流离失所者甚多”。
根绝弊端的办法，章程中指出“藏属人民，应禁止私占”，明显是想恢复五世达赖时的状况，但也只是说说而已，做不到了。
多尔济的第三项措施，是设法让曾巴得到五世班禅的认可。
他带着重礼前往扎什伦布，向五世班禅献上大片肥沃的农田牧场，然后告知：“五世达赖转世真身已找到，请求师父前往拉萨授戒。”五世班禅默思良久，才说：“老僧可以前往拉萨，但老僧授戒，须保证两件事：一、老僧须察看真身是否果真聪慧灵异，二、汗王须请出甘丹寺池巴主持法会仪式。”又说，“汗王，真身与否，关键在三大寺的态度，甘丹池巴乃大师化身，若能出面，方可服人心。”
1707年，康熙四十六年，甫过新年，五世班禅启程，抵拉萨时，受到汗王府、第巴府、三大寺代表隆重欢迎。随即住进布达拉，通过一个月的接触，对曾巴这位勤奋好学、朴实厚道的年轻人，留下良好印象。得知曾巴曾在药王山学医并执教，交谈之下，脱口赞道：“真乃好门巴。”后来有人据此称之为门巴喇嘛，也有人推测，这其实是班禅佛爷暗示曾巴并非达赖真身。种种说法，不一而足。
二月二十五日，曾巴在宫中色喜彭措大经堂，向五世班禅磕头，正式行了拜师礼。三月初八，在大昭寺释迦牟尼像前，由甘丹池巴恰巴活佛主持，班禅为曾巴剃发，授沙弥戒，取法名伊喜嘉措，承认了他的达赖喇嘛身份。
但如果新达赖还是进不了哲蚌和色拉的大门，其合法性将受质疑。经多方疏通，总算达成协议：由班禅佛爷分别为二寺部分僧众授戒，届时，伊喜嘉措可随同前来，但只称其为“阁下”。多尔济闻之，也只得睁一眼闭一眼，含糊了事。四月十七日，二寺举行了授戒法会。五世班禅为了表示谢意，共用数十万斤青稞到三大寺熬茶、放布施。
五世班禅直至七月中旬才离开拉萨，期间向曾巴传授了多部显密经典。
拉昌汗为报答，再向扎寺赠送多处庄园。
然而，还未等多尔济喘口气歇歇，安多方面又传来消息：以罗卜藏丹津为首，各位王公联名向朝廷上书，状告多尔济所立达赖并非真身，欺瞒皇帝云云。此刻的康熙和多尔济这两位始作俑者，为这真真假假大伤脑筋。尤其是王公们在奏折中流露出要“护教除奸”之意，令皇帝顿感紧张，于是立派大学士拉都浑赴藏“看验”。
多尔济向钦使说明，转世灵童经五世班禅确认，“实系达赖喇嘛，我始为之安置禅榻，非敢专擅”。拉都浑回京禀报了“看验”始末，议政大臣认为“拉昌所立达赖喇嘛，既问之班禅呼图克图，确知真实，应无庸议。”又建议，“青海众台吉等与拉昌不睦，西藏事务不便令拉昌独理，应遣官一员前往西藏协同拉昌办理事务。”康熙准奏，派侍郎赫寿前往。为避免矛盾激化，对达赖封号，“再阅数年，始议给封。”此为有清一代，特简大臣驻藏办事之始。
三年之后，即1710年，康熙四十九年，根据拉昌汗与赫寿请求，朝廷为伊喜嘉措颁赐印册，正式封为六世达赖喇嘛。
从表面上看，新达赖完成了确认和册封的程序，似乎可以告一段落，其实暗潮汹涌，局势仍然不稳定。1713年，康熙五十二年，皇帝下谕：“班禅呼图克图，为人安静，熟谙经典，勤修贡职，初终不倦，甚属可嘉。着照封达赖喇嘛之例，给以印册，封为班禅额尔德尼。”从此，班禅这一名号被朝廷认可，其后转世均由中央政府正式册封。清政府于此时抬高班禅的地位，显然是希望他协助拉昌汗稳定局势。