卡卡西作为暗部成员，也参与进了大蛇丸的抓捕行动。
面对拥有‘三忍之一’威名的大蛇丸，暗部成员都不敢大意。
“大蛇丸，你用村子忍者进行人体实验和研究禁术，四代火影大人已经下令将你抓捕，不要试图反抗了！”
“呵呵，没想到水门的消息这么灵通，不愧是火影，安插了不少眼线吧，想让我束手就擒？没那么容易！呜诶”
万蛇罗之阵！
大蛇丸从口中吐出大量的蛇群，将地下基地的通道堵住，无差别攻击前来抓捕他的暗部成员，身后跟着一袭白衣孩子，是唯一一例成功移植柱间细胞的活体，对于木遁这种已经成为传说的血继限界，大蛇丸自然不会放过，毕竟初代火影的强大是共识。
整个基地内部一片死寂，大蛇丸已经将‘根’的留守人员全部杀害。
卡卡西手握太刀与众人一起应对蛇群，在狭小的洞穴地道内，众人都无法使用大范围的忍术。
土遁·土流壁。
卡卡西使用土流壁将蛇群隔开，只要将大蛇丸困在地洞之中就行。
土流壁刚刚将通道封住，就被庞然大物瞬间撞碎。
暗部成员都被掀飞出去，大蛇丸和大和站在万蛇头顶，直接冲破头顶的土层来到地面之上。
卡卡西推开碎石冲出地洞，外部警戒的暗部成员也被万蛇打散，一时间全都负伤。
面对万蛇这样的顶级巨型通灵兽，上忍也无能为力。
卡卡西将太刀收回背后，看着不断攻击万蛇，大蛇丸用不了多久就会撕开暗部成员的防线。
卡卡西将查克拉凝聚在右手，使用雷切，随后向着万蛇跑去，同时开启了左眼的写轮眼。
暗部成员不断使用忍术攻击万蛇头顶的大蛇丸，但这些攻击对于体型巨大的万蛇来说只是挠痒痒而已。
这也给了卡卡西机会，冲到了万蛇的背上，手中雷光大振，飞快冲向大蛇丸。
大蛇丸使用潜影多蛇手，数条蝮蛇攻向狂奔的卡卡西，开启写轮眼的卡卡西巧妙地躲避攻击，右手径直穿过大蛇丸的腹部。
大蛇丸化作一个泥人裂开。
土替身·裂。
土替身！卡卡西瞳孔微缩，右手被卡在泥土之中。
大蛇丸使用蛇肢硬化，从卡卡西身后用手掌插入后背，溅起鲜血。
“水门的弟子，呵呵”
随后大蛇丸脸色一变。
“不对，幻术”
大蛇丸挣脱卡卡西的幻术，卡卡西手持雷切已经临近身前。
大蛇丸身体极度扭曲，躲开卡卡西的雷切，缠绕在卡卡西身上，吐舌蛇信，盯住卡卡西的右眼。
“写轮眼，真是一个有趣的血继界限，宇智波竟然会允许它留在一个外人身上”
大蛇丸将手伸向卡卡西的左眼，将其当做实验的材料，对于写轮眼的研究很感兴趣，以前在村子里无法对宇智波一族下手，现在既然已经暴露，就不用再顾忌了。
突然，水门身披火影袍出现在大蛇丸身后，被水门手中的苦无斩中身体，大蛇丸缠住卡卡西的身体一松，卡卡西挣脱退到一旁。
被击中的大蛇丸猛然张开嘴，沾满粘液的双手撕开嘴从体内钻了出来，完好无损，瞬间与两人拉开距离。
大蛇丸清楚，水门攻击的那一刻，自己就已经被刻上了飞雷神的术式，所以使用大蛇流替身术将其摆脱。
而原本卡卡西所在的位置脚下赫然插着那枚水门送给他的飞雷神特制苦无，水门将其捡起抛给卡卡西。
“老师”
卡卡西喊了水门一声，水门就是靠这枚苦无的飞雷神印记瞬身而来。
“大蛇丸，你残害同胞，你想干什么”
“呵呵呵，水门，你不会懂的，我追求的是永恒的生命，为此我什么都可以抛弃”
“我不会让你如愿的，大蛇丸，从现在起，你就是村子的敌人！”
“村子对我来说可有可无”
大蛇丸从口中吐出长蛇咬向水门，水门蹲下将手按在万蛇的鳞片之上，直接使用飞雷神之术将万蛇和自己转移，此处临近木叶，下方还有众多受伤围攻的暗部成员。
随后又通过卡卡西手中的飞雷神苦无瞬身回来，将数枚飞雷神苦无射向空中的大蛇丸，利用飞雷神二段出现在大蛇丸身侧，出现的瞬间手中螺旋丸一发击中在大蛇丸身上。
卡卡西在空中接住大和，落在树上，观望空中的战斗。
大蛇丸砸入地面，从灰尘中走出。
“不愧是黄色闪光，二代的飞雷神在你手中真是强大”
大蛇丸半身淌血，断裂的左臂缓缓再生。
水门出现在对面。
“大蛇丸，你的人体实验太残忍了，村子不能容许你的行为”
“呵呵”
大蛇丸不慌不忙，咬破右手按在地上使用通灵术。
“这个忍术还不完善，不过，没关系”
“秽土转生！”
随着大蛇丸一声大喝，两具棺木从黑暗中缓缓升起，棺盖落下露出两道身影。
黑色长发，身披红色叠甲，另一身影则是白发蓝甲。
波风水门瞳孔一缩，大声喝道。
“初代和二代！大蛇丸，你做了什么”
“哈哈哈哈，水门，这就是二代的禁术·秽土转生，被你们封禁的忍术”
波风水门手持飞雷神苦无，戒备地看向走出棺木的两道身影，大蛇丸竟然掌握了通灵死者的禁术。
千手柱间和千手扉间身上布满裂纹，漆黑的瞳孔，像是两具傀儡。
“感受木遁的强大吧，水门”
初代火影千手柱间一脚踏出怪力踩碎地面，同时地下生出巨型树根钻向波风水门，从脚底冲出巨树。
这确实是木遁，真的是初代！
水门心中一惊，但是看对方的状态似乎不对劲，应该是大蛇丸在控制他们，所以必须快速将大蛇丸解决。
大蛇丸口中吐出鲜血，刚刚水门的攻击结结实实地打在他的身上，可不好受。
秽土转生二代火影千手扉间双手结印，瞬间召唤出一道涡流盘旋而上形成一道巨型的水龙弹冲天而起。
水龙弹朝着水门袭去，水门使用飞雷神之术闪身躲过落在树干上，四周已经插下了他的飞雷神苦无。
“暗部成员全部撤退，在四周警戒，不要让大蛇丸逃走”
水门下令将战场清场。