《钦定科技振兴诏》的颁布，如同在沉寂的潭水中投入巨石，其涟漪迅速扩散至新政掌控的每一个角落。天工院的地位被正式拔高至与六部比肩，稳定的财源与制度化的奖励，使得以往更多依赖于个人兴趣或上级指令的“格物”活动，开始呈现出系统化、规模化的趋势。然而，随之而来的，是一种更深层次的需求——将那些零散的技术突破、实践经验、乃至源于张明远手稿的超越性理念，进行系统性的梳理、归纳与升华。
林庆云首先感受到了这种压力。百草阁内，各类新发现的药性记录、提纯工艺、防疫章程堆积如山；实验室中，分馏产物的性质数据、新式材料的制备方法也需要规范记录。这些知识若始终停留在口耳相传或散乱笔记的层面，极易失传或产生谬误，更难以大规模培养后继人才。
几乎在同一时间，苏婉清也面临着类似的困境。机巧坊的图纸日益复杂，水力工坊的运行维护需要标准规程，新式千里镜、水平仪等光学仪器的制作更需要精确的镜片曲率参数和装配标准。缺乏统一的理论框架和表述规范，技术的传承与推广效率将大打折扣。
一种无形的默契在两人之间形成。无需过多言语，他们几乎同时开始了各自领域的理论奠基工作。
林庆云将自己关在实验室与藏书室中。他面前摊开着师父张明远那字迹潦草、图示精奇的手稿，以及自己多年来积累的实验记录和病例总结。他要编撰的，不是一本传统的、充斥着阴阳五行理论的医书，而是一部立足于实证、阐述物质性质与变化规律的 《化学基础论要》。
这项工作极其艰难。他需要将手稿中那些诸如“元素”、“化合物”、“氧化”、“酸碱”等超越时代的概念，用此世能够理解的语言和比喻进行阐释。他摒弃了玄虚的论述，坚持以观察和实验为依据。例如，他通过煅烧石灰石得到生石灰，再加水生成熟石灰并放热的过程，来直观地说明“物质变化伴随性质改变与热量转移”；他通过金属在空气中锈蚀、在酸中溶解的现象，来引出手稿中提及的“氧化”与“置换”概念雏形。
他力求文字简洁、定义清晰、例证确凿。书中不仅收录了提纯青霉素、分馏石油等重大成果的简化流程，更着重阐述了实验方法、观察记录的重要性，以及“大胆假设、小心求证”的格物精神。这已不仅仅是一部技术手册，更是一部科学方法的启蒙之作。
与此同时，在机巧阁内，苏婉清的工作则更侧重于结构与逻辑。她编绘的 《机械原理图说》 ，与其说是一本书，不如说是一套标准化的工程语言。她首次系统地引入了标准图示符号（如不同线型代表不同结构，特定符号代表齿轮、轴承、连杆等），三视图与剖面图的表达方法，以及基本的力学概念（如杠杆、滑轮、斜面省力原理，摩擦力、重心的影响等）。
她没有直接引入牛顿力学公式，而是通过大量精心绘制的实例图，配合简洁的文字说明，来直观展示不同机械结构的传动方式、受力分析与效率关键。从最简单的水碓、桔槔，到复杂的水力锻锤、千里镜调节机构，她都一一分解剖析，将其中的“理”清晰地呈现出来。书中还专门设立了“公差与配合”、“材料强度简述”等章节，强调标准化与可靠性在机械制造中的基石作用。
两人的工作几乎是同步进行的，过程中难免需要相互印证、探讨。林庆云会向苏婉清请教某些装置（如分馏设备）的结构强度与密封问题，以确保其描述的准确性；苏婉清则需了解某些材料（如不同金属、琉璃）的物理化学性质，以充实其《图说》中的材料篇。
这一日，朱棣在姚广孝的陪同下，亲临天工院，视察这两部关乎“北学”理论根基的着作编撰进展。
他先来到百草阁，林庆云恭敬地呈上已初步成形的《化学基础论要》手稿。朱棣翻阅着那些以工整楷书誊写、配有精细图示的纸页，看着其中虽显陌生却逻辑严密的论述，尤其是那些基于实验的、确凿无疑的结论（如某些物质混合会产生气体或沉淀，某些反应会放热或吸热），久久沉默。
“此书……所言，皆可验证？”他抬起眼，目光锐利地看向林庆云。
“回殿下，书中所述核心原理与关键实验，皆经臣反复验证，或有疏漏，然绝无虚言。”林庆云坦然回答。
朱棣合上书稿，手指轻轻敲击着封面，对姚广孝道：“若依此书中之理，则万物变化，似有迹可循，非全然天命莫测矣。”他的语气中带着一丝不易察觉的震动。这部书，正在悄然撼动某些根深蒂固的认知。
随后，他们移步机巧阁。苏婉清将《机械原理图说》的草稿铺陈开来。那清晰规范的图示、精炼准确的术语、以及对机械运作原理的透彻剖析，让即便是对工巧之事并不精深的朱棣与姚广孝，也能大致看懂其门道。
“以此图说，即便新晋匠人，按图索骥，亦能知其所以然，而非徒具其形。”姚广孝看着一幅关于齿轮传动的分解图，不禁赞叹，“此乃授人以渔之道。”
朱棣的目光则落在了苏婉清身上，这个沉默寡言的女子，竟能以如此系统、严谨的方式，将纷繁复杂的机械之理梳理得条清缕晰。“苏姑娘此书，可与庆云之《论要》，并称为我天工院之‘格物双璧’。”他难得地给出了极高的评价。
然而，在翻阅过程中，朱棣也敏锐地察觉到了两者风格的微妙差异。林庆云的《论要》带着一种从传统医药、炼丹术中蜕变而来的痕迹，虽力求实证，但某些阐述仍带有类比和想象的色彩；而苏婉清的《图说》则呈现出一种近乎冷酷的理性与精确，其图示与表述方式，简洁、高效，仿佛剥离了一切不必要的修饰，直指核心。这种差异，如同两种不同源流的河水，在此刻汇合。
“你二人一重‘化变’，一重‘形构’，”朱棣缓缓道，目光深邃，“一者探究万物内在性质之变，一者穷究器物外在结构之理。相辅相成，方为完整的格物之道。”
林庆云与苏婉清皆躬身称是。
望着这两部即将定稿、注定将影响深远的着作，朱棣心中感慨万千。张明远留下的星火，至此，终于不再仅仅是零散的技术成果，而是开始凝聚成可以传承、可以发展的知识体系。这才是“火种”真正可怕，也真正可贵的地方。
“加紧刊印。”朱棣最终下令，“先于天工院内讲授，择其要者，下发各州县工坊、医署。我要让这‘北学’之理，不再是少数人掌握的秘术，而是人人可学、可用的公器。”
薪火，至此方算真正具备了“相传”的形态。
而一个以“格物”为核心的、迥异于传统儒学道统的新知识体系，终于在洪武末年的北方，露出了它稚嫩却充满生命力的萌芽。这萌芽之下，是林庆云继承自过去的智慧，是苏婉清来自异世的灵魂，更是这个时代在裂变中寻求新出路的迫切渴望。