在与佛德先生告别以后，小智一行人横越了整个小桔岛，终于来到了此行的目的地——大都会，而紧跟在三人身后的，正是一只阴魂不散的火箭队三人组
“嘿嘿，趁那些小鬼头看风景看呆的时候”
“好久没有回到基本面进行陷阱计划了”
“陷阱归陷阱，那是高科技的计划了，首先在地下挖个洞，安装上地面炸弹，然后在时间到的时候引爆，地面就会出现一个大洞，我们计划就成功了”
可是就在小次郎观察腕表时，时间刚好到达引爆火箭队三人组脚下，瞬间出现一个大型空洞，将他们掉了下去，而下方的小智一行人脚下也因为刚刚的爆炸出现了一个大坑
而当三人再次醒来时，便出现在了一个由岩石构成的横向洞穴里，而在来到隧道入口后，小智一行人便出现在了大都会的地下道内
“这里是什么地方啊？”
“小智，这里应该就是大都会的地下道了，我们四处找一下，看看有没有出去的井盖吧”
“为什么这里会有铃铛声呢？”
听觉敏锐的娜姿似乎听到了某处传来的铃铛声，随即在三人面前就出现了一根巨大的藤鞭
“这是什么？皮卡丘，使用电击绝招”
“等一下，小智这里四处都是水，如果导电的话，我们也会受伤的”，娜姿急忙拦下了下令攻击的小智，随后看了看四周不断流出的水流，提醒着他
“说的也对，伊布，交给你了，使出高速星星”
“布伊～”
小智右肩膀上的衣物一跃而下，口中不断吐出了大量白色的高速星星进行攻击，但那根巨大的藤鞭却挥舞之间将高速星星打散，并将伊布抓起来拖下了水
“伊布！等着我，我现在就来救你”，小智刚想跟着藤鞭的方向跳下水，就被身后的娜姿一手刀打晕在地上
“娜姿，你干什么？”
“让小智先冷静一下，毕竟我们对这里不熟悉，如果迷路的话就糟糕了，而且你不觉得那根东西很像藤鞭吗？而且是妙蛙种子的藤鞭”
“藤鞭……确实很像，我想起来了，我记得之前小智和我说过，我记得曾经小智跟我说过，大都会的地下水道内生活着一只被抛弃的妙蛙种子”
“看来你还不笨嘛，既然是只妙蛙种子的话，我想伊布不会有事的，还是先把小智带上去吧，万一他醒过来再脑子一热跳下水，那就糟糕了”
“好，就这么决定，那我们继续往前走吧”
商量好后，娜姿和小银就一人一边将昏迷的小智搀扶起来，皮卡丘也顺势站到了纳兹的肩膀上，三人就这么朝着出口的位置开始不断的前进
而上方的井盖忽然打开，君莎小姐的身影赫然出现在利用绳子爬上井盖后，君莎小姐便将他们带到了警局的牢房之中
“放我出去，快放我出去，我要去救我的伊布啊，快放我出去”
牢房中醒来的小智不断的拍打着大门，而一旁的娜姿和小银则默默的坐到了床上，看着小智那副着急的样子
“小智，先安静一点吧，君莎小姐一会儿就会给咱们开门来了，而且伊布是不会有事的，在下水井道里的那只是被抛弃的妙蛙种子”
“被抛弃的妙蛙种子？”
听到娜姿的话，小智回头疑惑的看着对方，这时君莎小姐却将门打开拍到了小智的鼻子上，顿时小智鼻孔中喷出了一道鼻血痛苦的捂着鼻子
“好痛好痛”
“对不起啊小智，我不知道你在门后边，而且把你们带进来也是无奈之举”
“君莎小姐到底是发生什么事了？而且为什么我感觉每个地方的君莎小姐和乔伊小姐都认识我？”
“这个嘛，当然是因为玲子和明美那两个孩子，还有乔伊家族的美雪和月子，这四个孩子啊，在家里的照片都给我们发了一个遍，我们当然很熟悉你喽”
听着君莎小姐的解释，小智这时也恍然大悟，询问起了地下水道的事情，君莎小姐刚想解释其原因，身穿一身橘色服装有着两撇大胡子的中年肥胖市长便走了进来
而当听闻市长将要全面封锁地下水道以及君沙小姐的解释后，小智怒不可遏的想要上前与市长理论，但却被神情冷漠的娜姿和小银拉了
“小智，这件事情暂时先不要搭理他，最后一定会有人来收拾他的，他会自食恶果”
“没错小智，你就等着看最后的结局吧，像他这样的家一定会自作自受的”
听着两人的话以及感受到肩膀上传来的压力和腰间的疼痛感，小智顿时安分了下来，随后再来到宝可梦中心，在乔伊小姐那里得知市长准备组织人手前往地下水道抓捕神秘生物时，小智立刻激动的站了起来
“什么他怎么可以这么做？那家伙凭什么这么做？那下边并不是什么神秘生物，那是一只妙蛙种子啊，而且我的伊布也在里面”
“那家伙是想连任市长的时候少一些阻碍，所以才会做出这样的事情的，而且现在既然知道了，那里面是只妙蛙种子，那就好办了
小智，我知道有一处管道可以再一次进入地下道内，但会有些危险”
“没关系的，乔伊小姐，不管有多危险，我都要去救我的伊布，还有那只妙蛙种子，我也要把它带上来”
看着小智坚定的眼神，乔伊小姐便带着三人来到了一处地下管道的入口，很快，小智一行人便进入地下管道内，开始四处寻找起伊布和妙蛙种子的身影
而在经过一处水下管道时，那粗壮的藤鞭再一次升起，小智见状，不由分说的立刻跳下水沿着藤鞭伸出的方向向前，娜姿和小银也在对视一眼过后，紧接着跳了下去
但在来到了地下水道的密室后，小智三人见到了一只巨大的妙蛙种子以及完好无损的伊布
“伊布你没事，真是太好了”
“布伊～”
“是你看这只妙蛙种子的脖子上系着一个铃铛，这好像就是那个市长的专属标志，所以说这只妙蛙种子是被他抛弃的”
“真是个可恶的家伙，娜姿姐，小银，我们带着妙蛙种子一起上去”
很快，三人便带着妙蛙种子走出了地下管道，见到了在这里等待的乔伊，并且乔伊小姐还联系了君莎小姐一起等待
在看见小智他们安然无恙出来后，又看了看一直跟在小智脚边的妙蛙种子，在认出上面的标识后立刻带着他们来到了市长家中，找到了正在遇见的市长，妙蛙种子直接伸出藤鞭将市长高高举起带到外面
而在市长的亲卫队赶到时，皮卡丘使出了十万伏特伊布，也变化成雷精灵同样使出十万伏特在一道道电机下亲卫队立刻被电麻在地上，市长也被妙蛙种子扔了出去
随后，在君莎小姐的指引下，三人准备搭乘通信船前往大都会附近的柚子岛，挑战柚子道馆，而那只妙蛙种子则是被相中演员的娜姿所收服