随着秦凡分化出无数的意念阴阳分身，在混元宇宙下位面凡间界，统一了所有生命星辰之上的势力，并制定了凡医门的规则，以普通众生灵为本，凡医门宗旨是救死扶伤，秦凡在每个星辰之上，都留下了医道传承，随着凡医门在世行走弟子的出现，所有凡间星辰都出现了淡淡的信仰之力。这些信仰，都是众生为了感激秦凡，让他们免除了常年处于战乱的环境，给了他们一个太平盛世。只是并不是所有人都感激凡医门，有正就有负，凡医门的出现，动了很多人的利益蛋糕。
在一个偏远，却资源丰富的星辰之上，有个名为灵医盟的组织，他们向来以高价治病、谋取暴利手段。就连偏远的星辰之上都有灵医盟这样的组织，何况其他生命星辰了。凡医门的出现，让他们的生意一落千丈，成员们怨声载道。灵医盟盟主得知后，怒不可遏，决定联合其他被凡医门影响利益的势力，共同对抗凡医门。各个星辰之上都出现了敌视凡医门的情况。
他们暗中集结人手，准备对凡医门在世行走弟子下手。一天，凡医门几位外出采药的弟子，在山林中遭遇了灵医盟的埋伏。灵医盟的人，仗着人多势众，步步紧逼。凡医门弟子们虽不擅长战斗，但他们牢记秦凡的教诲，临危不乱，一边防御，一边等待支援。就在局势危急之时，一道光芒闪过，秦凡的意念阴阳分身，及时赶到，挥手间，那些妄图破坏凡医门的人，便被一股强大的力量击飞，纷纷倒地。“凡医门在世行走弟子，救死扶伤，受此方空间信仰功德加身，得神庇佑，岂是尔等可以冒犯的。”
灵医盟盟主见状，心中虽惧，但仍强撑着“秦凡，你莫要以为统一了各星辰势力就能为所欲为，我们联合起来，也不是好惹的！”
“我不过是行医道正义之事，尔等却为一己私利，妄图破坏凡医门，今日若不惩戒，难平民愤。”说罢，秦凡分身双手结印，施展出阴阳之力凝聚成符文，一道道符文闪耀着化作绳索将灵医盟众人束缚。那些被束缚的人开始挣扎求饶，秦凡却不为所动。
他看着灵医盟盟主，“我可给过你们机会，若你们能改过自新，不再以治病为由谋取暴利，便也作罢，只是你们为了生存，竟然巧取豪夺，甚至为了催债，逼死众多无辜之人，害了无数家庭，本少岂能轻饶”随后，秦凡将这些人带回凡医门，让他们学习凡医门的宗旨和医道传承，给他们种下了魂奴印，让他们为善百年抵消罪孽。经此一役，其他妄图与凡医门作对的势力，也都收敛了心思，凡医门在混元宇宙下位面凡间界的地位更加稳固。
“元柔，你可知，少爷为何要这么大费周章，来这下位凡间位面，搞什么凡医门救死扶伤，以他现在混元宇宙之主的身份，何必在乎凡人死活”
“元坤姐，我猜少爷是想获得凡间位面众生信仰，所以才做出这等善举，不过混元宇宙自古以来都是谁拳头大，谁说了算，适者生存，少爷这强势成立凡医门，怕是阻力不会小。”
元坤轻轻摇头“我看不止如此，少爷心怀悲悯，或许真的是想拯救这些凡人。只是这阻力，恐怕才刚刚开始。” 就在这时，混元空间中突然传来一阵异动，一股强大且邪恶的气息弥漫开来。秦凡感知到这股气息，嘴角露出笑意，仿佛早有预料，动了下界位面所有势力之人的利益，相当于断了上界之人飞升后源。原来这次下界之人，只来自元灵界高层的恶势力，他们从飞升之人处了解了下界消息，知道了秦凡在凡间位面的举动，认为他此举打破了元灵界势力平衡。
这股恶势力派出了一名强大的使者，降临到了凡间位面，目标直指凡医门。秦凡早就有所预料，凡间位面是上界飞升势力的基石，被突然出现的凡医门整合，动了整个飞升势力的蛋糕。相当于断了他们新生弟子的来源。
那使者身形高大，周身散发着令人胆寒的黑色光芒，每一步落下，周围空间都为之震颤。他冷笑着看向秦凡意念阴阳分身“你坏了规矩，今日便让你付出代价。”秦凡意念分身目光坚定，丝毫不惧，“我所做之事，问心无愧。这凡间众生，不该被你们随意剥削。”说罢，秦凡率先出手，调动阴阳之力，化作一道道凌厉的阴阳符文，朝着使者攻去。使者轻蔑一笑，抬手一挥，黑色能量如汹涌的潮水般将符文吞噬。
只是刚吞噬，就被阴阳符文从内部吸收炼化，反而加快了瓦解黑色能量的速度。使者大惊失色，“你的实力果然不容小觑，竟然还只是道分身随意打出的力量，你究竟是谁？凡间位面，不应有你这么强大的存在？”
秦凡意念分身：“你还不配知道本少名讳，本少这是为凡间众生谋福祉，这只是第一步，第二步就会去整合你所在的元灵界。”使者冷哼一声“好大的口气，管你是谁，坏我等好事，就得死。”说罢，他周身黑色光芒大盛，双手舞动，召唤出无数黑色尖刺，如暴雨般朝秦凡射去。秦凡分身不慌不忙，双手结印，阴阳之力在身前，凝聚成一面巨大的阴阳护盾。尖刺撞击在护盾上，发出阵阵巨响，但护盾却稳如泰山。
紧接着，秦凡趁使者攻击间隙，分身化作一道流光，瞬间出现在使者身后，抬手便是一道阴阳斩击。使者反应极快，侧身一闪，斩击擦着他的身体而过，将他身后的空间斩出一道巨大的裂缝。使者怒极，他拿出一件黑色法宝，口中念念有词。法宝散发出强大吸力，妄图将秦凡吸进去。秦凡运转阴阳之力，形成一股反吸之力，瞬间把对方黑暗力量吞噬炼化。使者直接被一道阴阳之力封印。
秦凡思索着，看来真的动了不少人的利益蛋糕，竟然派了合体修为境界之人，来这凡间位面解决凡医门了。看来元灵界，元仙界也是时候，建立凡灵门、凡仙门势力了。秦凡无数意念又纷纷涌入元灵界，元仙界，对应能量凝聚无数阴阳意识分身。元灵界、元仙界所有生命星辰，被突然出现的势力，凡灵门、凡仙门一统。直接从根源杜绝了他们，再派使者去凡间位面破坏凡医门根基的情况。
然而，秦凡此举，虽暂时稳住了局面，却引起了更高层次存在的注意。在神元界虚空中，一双冰冷的眼眸注视着这一切。很快，一道神秘的诏令，从神元界深处传出，要求秦凡前往神元界裁决之地，解释他的所作所为。秦凡有些嗤之以鼻。秦凡声音响彻整个神元界。“本少爷如何做，何须向你等蝼蚁解释”
秦凡的回应，让神元界一阵哗然，那神秘存在显然没料到秦凡如此强硬。瞬间，神元界裁决之地，爆发出一股毁天灭地的力量波动，一道巨大的身影，从裁决之地深处缓缓浮现，竟是神元界的至高裁决者。
裁决者冷冷开口：“无知小辈，敢如此狂妄，今日便让你付出代价。”说罢，他大手一挥，无数道神元法则之力，如闪电般朝着秦凡袭来。秦凡火属性混沌之体出现，一挥手，法则之力消失不见。
“你身为神元界高等生灵，随意在下界位面出手，对元灵界和元仙界生灵置之不顾，本少爷罚你去轮回，十世为善，积累足够功德之力，方能抵消自身罪孽”
“哈哈，你以为你是谁，我可是元氏嫡系，元家老祖元天可是混元宇宙掌控。”
秦凡闻言，眼中闪过一丝不屑，“元氏嫡系又如何，即便你背后是元天，在我眼里也不过如此。今日我便要替这三界众生，教训教训你这不知死活的东西。”说罢，秦凡挥手间，把这位自称至高裁决之人，拉入混元府空间，随后周身气势暴涨，混沌之火熊熊燃烧，将他整个人映照得宛如战神下凡。他双手结印，混沌之力凝聚成一柄巨大的混沌神剑，朝着裁决者斩去。
裁决者没想到秦凡如此大胆，竟敢主动进攻，心中一凛，连忙运转神元法则之力，化作一面巨大的盾牌抵挡。只是盾牌仿佛根本不敢抵挡秦凡的攻击似的，刚凝聚成型，就自动溃散。秦凡这才下意识反应过来，这一剑下去，可能就会把裁决者打的魂飞魄散，心念一动，剑化掌心，裁决者只觉一股强大的力量袭来，身体不受控制地向前飞去，撞在混元界一颗星辰之上。裁决者稳住身形，眼中满是愤怒，“你竟敢伤我，我今日定要将你碎尸万段。”
就在裁决者想继续攻击秦凡之时，混元宇宙中突然传来一阵悠扬叹息，一位神秘老者凭空出现。老者不怒自威“混蛋小子，不得对秦少爷无礼，快住手，秦少爷举虽打破常规，但也是为众生谋福，神元界也该顺应大势。”裁决者见老者出现，脸色一变，竟不敢再动手。秦凡看向老者，心中满是疑惑。老者究竟是何方神圣，又为何会在此刻出现？
“秦少爷，我是神元界，元氏神灵族长，元林山，我接到元氏老祖宗元天的命令，神元界元氏家族一切，都听从秦少爷吩咐。”元林山想起老祖宗元天的吩咐，内心还在震惊不已。心中暗自感叹“这秦凡究竟是何身份，竟然连老祖宗元天都称呼他为少爷，自己连叫少爷的资格都没有。也只能尊称喊一声秦少爷。”
秦凡微微一怔，没想到背后是元天的意思。随意挥了挥手：“既如此，元族长就有你依照神元界下界的凡仙门、凡灵门和凡医门的门规，在神元界成立凡神门势力，也有你去执行，就按照凡医门、凡灵门和凡仙门的行事准则标准建立，去吧”
“秦少爷放心，神元界元氏家族，定会全力支持。我这便召集族中高手，按秦少爷吩咐，前往各界，震慑那些妄图阻拦之人。”元林山这位站在神元界之巅的大佬，竟然不敢有丝毫忤逆之色。
说罢，元林山双手结印，瞬间，神元界各处光芒闪耀，数位实力强大的元氏族人，出现在秦凡面前。秦凡看着这些人，暗自点了点头，开始当起甩手掌柜。那些原本反对的势力，在元氏家族的威慑下，纷纷偃旗息鼓。凡医门、凡灵门、凡仙门和凡神门的建立，在混元宇宙中逐渐深入人心，众生也在秦凡这位混元宇宙主宰引导下，迎来了新的生机。
直到混元宇宙空间渡过百年时光，神元界百年，凡间已千年。虽然暗中还有一些地下敌对势力，秦凡并未过多干预，就当给凡医门，凡灵门、凡仙门和凡神门弟子的试炼对象，权当磨刀石了。千年过去，凡医门、凡灵门、凡仙门和凡神门的弟子们，在与地下敌对势力的交锋中成长迅速。然而，一场更大的危机悄然降临。混元宇宙深处，一股古老而邪恶的力量复苏，它察觉到了秦凡所带来的变化，认为这破坏了混元宇宙阴阳平衡，断了他们邪恶能量来源。
这股力量派出了强大的魔使，来到凡间位面，煽动那些地下敌对势力联合起来，对凡医门、凡灵门、凡仙门和凡神门，各个位面四门，发起全面进攻。一时间，战火纷飞，各界四门弟子，顿时陷入了苦战。秦凡感知到这股邪恶力量的威胁，并未亲自出手。他只是施展无上神通，降临战场，把那些强大的邪恶魔族全部镇压。直到各界四门弟子足以应对，才收手。经此一役，凡医门等四门的威望达到了顶峰，混元宇宙也迎来了长久的和平。
至此，秦凡才得到混元宇宙众生意志的认可，彻底掌控了混元宇宙。掌控混元宇宙后，秦凡并未懈怠。他开始着手梳理宇宙法则，试图让整个宇宙更加有序。而且秦凡可以利用黑洞本源之力，瞬间逆转整个混元宇宙阴阳时空，可以让混元宇宙逆转时空回到过去。只是一旦逆转时空，生灵带着潜在记忆回到过去，小范围改变历史还无所谓，一旦这个生灵强大到，足以影响整个混元宇宙历史运转轨迹，牵一发而动全身的时候，很多既定的历史轨迹就会被改写，那些已经产生的生命魂灵，都将随着历史轨迹改变而消散。看来要把时空法则抽离，避免众生灵领悟时空法则，从而穿越回到过去，改变历史，扰乱混元宇宙正常有序发展。
秦凡恍然明白，为何自己在现实世界，不能完全领悟时空法则，看来大道规则遁去其一，就是时空法则。就在秦凡混沌火属性分身领悟时空法则之时，秦凡本体也瞬间顿悟生灭宇宙空间的时空法则，生灭黑洞比之前扩大了万倍不止。星云宇宙空间仿佛有了生命一般，补全了时空法则。星云宇宙中，众生仿若隔世一般。秦凡本体挥手间，逆转阴阳时空，让星云宇宙时间倒流回到一周前。生活在星云宇宙空间之中的众生，仿佛又重新来过，看什么都是无比熟悉。
秦凡本体把星云宇宙之中，时空大道规则抽离，放入生灭黑洞之中，时空大道规则仿若一条时间长河，冲刷着星云宇宙和毁灭宇宙两方宇宙空间，而且秦凡发现，以前星云宇宙每层空间之中由于空间能量不同，所以时间流速也不一样，自然运转的情况下，上层空间流速是下层空间流速的百倍，但是随着时空大道规则被抽离，冲刷着整个星云宇宙，这就导致整个星云宇宙和毁灭宇宙都处在同一时间流速水平之上。秦凡本体无比欣慰的看着自己创建的两方宇宙，看来以后还要多建立一方平行宇宙空间才行，主要是为了防止有生灵领悟时空大道规则，回到过去改变历史，这样就算他改变了历史轨迹，也可以把历史已经既定产生的生命魂灵，拉入平行空间之中。至于平行宇宙空间的建立，心底已经拥有了想法。以待后续完善。
秦凡本体感叹不已，看来收服混元黑洞，比吸收、炼化、融合它的意义更大，如果当时自己只是吸收炼化它的混沌本源，壮大自己生灭黑洞，可能就会与顿悟时空大道规则失之交臂了。
秦凡火属性混沌分身，通过本体感受到生灭黑洞的重大改变，也是欣慰无比，随后陷入专心梳理法则之中，混元宇宙边缘，突然出现了时空紊乱的迹象。原来是有一群来自平行宇宙的邪恶入侵者，他们掌握了一种能扰乱时空的秘法，妄图通过破坏混元宇宙的时空秩序，来掠夺这里的能量。秦凡迅速感知到这一情况，他眉头紧皱，决定亲自前往宇宙边缘。
抵达后，他发现入侵者们，正不断释放扰乱时空的力量，周围的时空扭曲得如同旋涡。秦凡运转黑洞本源之力，试图稳定时空。可入侵者们也不简单，他们联合起来，施展出强大的攻击。秦凡毫不畏惧，以混沌阴阳之力与之对抗。在激烈的战斗中，秦凡逐渐摸清了对方扰乱时空的规律，他找准时机，用黑洞本源之力，将对方的时空扰乱力量反吸回来，瞬间将入侵者们困在扭曲的时空中。最终，入侵者们被彻底被击败封印，混元宇宙的时空秩序也逐渐恢复正常。秦凡深知，既然成为混元宇宙之主，那守护这方宇宙，他还有很长的路要走。
然而，就在他全身心投入时，宇宙深处突然出现了一个神秘的时空裂缝。裂缝中不断涌出奇异的能量波动，让秦凡心生警惕。
他亲自前往裂缝处探查，发现这裂缝连接着一个未知的神秘空间。秦凡刚靠近，裂缝中便射出一道诡异光芒，瞬间将他的部分意识卷入其中。在神秘空间里，秦凡看到了许多古老的画面，似乎隐藏着宇宙的终极秘密。但当他想要深入探寻时，神秘空间却传来一阵怒吼：“擅自闯入者，死！”
秦凡并未被这怒吼声吓退，他运转混沌之力，试图抵御这股强大的威慑。就在这时，神秘空间中浮现出一个巨大的幻影，这幻影似是空间的守护者。守护者冷冷声音传来：“这是宇宙诞生之初，就被封存的秘密之地，非有缘者不得入内。你虽强大，但也不能擅闯。”
“我身为混元宇宙之主，为了宇宙的稳定与发展，希望能探寻这其中的秘密。”守护者沉默片刻，“若你能通过我的三重考验，便让你继续探寻。”
“哪三重考验，我可以接受”
“第一重考验，是品性；第二重考验，是心性；第三重考验，是领悟。”守护者大手一挥，秦凡眼前场景变换，来到了一个繁华都市。这里百姓正遭受恶势力欺压，秦凡毫不犹豫出手相助，惩治了恶势力。之后又随即出现各种事件，从秦凡应对事件中，他展现出善良正义的品性，顺利通过第一重考验。
接着，场景又变，秦凡置身于无尽黑暗，各种诱惑之声在耳边回荡，有权力、财富、美色的诱惑。秦凡心如磐石，不为所动，以坚定的心性通过了第二重考验。
最后一重领悟考验来临，秦凡面前出现一本闪烁神秘光芒的古籍，上面的文字他一个都不认识。秦凡静下心来，运转混沌之力，试图解读其中奥秘。随着时间推移，他逐渐有所感悟，那些文字在他眼中变得清晰起来，他开始理解其中蕴含的宇宙至理，对时空法则领悟和运用更加透彻。当他完全领悟时，守护者满意点头，“你通过了考验，进去探寻秘密吧。”秦凡大步迈向神秘空间深处。
秦凡深入神秘空间，周围光芒闪烁，景象奇异。突然，前方出现一座古老的殿堂，殿门紧闭。秦凡刚靠近，殿门自动打开，一股强大的吸力将他卷入。殿内，悬浮着一本散发着神秘光芒的古籍。秦凡正要伸手去拿，古籍却化作一道道符文，组成一个巨大的法阵，将他困在其中。
法阵中，出现了诸多宇宙诞生之初的恐怖存在幻影，它们张牙舞爪地向秦凡扑来。秦凡运转混沌之力，与这些幻影展开殊死搏斗。每击败一个幻影，法阵便削弱一分。就在他即将突破法阵时，古籍再次变化，化作一个神秘老者。老者看着秦凡说：“你虽有实力，但这终极秘密并非轻易能得。若你能放弃探寻，我可保你平安离开。”秦凡坚定地摇头：“为了混元宇宙，我必须知晓这秘密。”老者微微一笑，消失不见，法阵也随之消散，古籍缓缓飞到秦凡手中。
这本古籍竟然是关于时空法则的介绍。秦凡迫不及待的翻阅起来，这本古籍记忆知识，竟然不是文字，每个字都是一个光球世界，进入光球世界，仿佛陷入了知识的海洋。秦凡发现要浏览完这本古籍，就要进入亿万个光球，浏览完每个光球世界知识，就需要消耗大量精力和意识。还好他已经是混元宇宙之主，不然光是一个字的光球知识世界，就会撑爆一位神帝神魂。
看来不止是黑洞孕育的宇宙空间中，拥有时空法则，就连这混沌空间同样有时空法则，难道这混沌空间也是有主人的。。。